Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph10bE9PYQ0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms