Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms