Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I6

Slfn2, Schlafen 2, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn2Q9Z0I6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slfn2Q9Z0I6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slfn2Q9Z0I6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms