Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms