Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ChmQ9QXG2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ChmQ9QXG2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms