Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK3

Cabp5, Calcium-binding protein 5, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp5Q9JLK3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cabp5Q9JLK3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms