Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
AatfQ9JKX4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms