Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rsph14Q9D3W1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms