Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snrnp35Q9D384 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms