Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syf2Q9D198 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms