Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc47Q9D024 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc47Q9D024 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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