Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Malsu1Q9CWV0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms