Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Pfdn1Q9CWM4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pfdn1Q9CWM4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms