Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pard3bQ9CSB4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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