Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ms4a4dQ99N05 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Ms4a4dQ99N05 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
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