Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprtQ99M80 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprtQ99M80 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms