Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q8CD60 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8CD60 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8CD60 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8CD60 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8CD60 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CD60 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CD60 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CD60 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CD60 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8CD60 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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