Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf31Q8CCF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf31Q8CCF0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms