Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc187Q8C5V8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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