Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp37Q8C0R0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp37Q8C0R0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms