Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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FarsaQ8C0C7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FarsaQ8C0C7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FarsaQ8C0C7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FarsaQ8C0C7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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