Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Pgam5Q8BX10 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pgam5Q8BX10 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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