Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8BGC1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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