Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Htatsf1Q8BGC0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms