Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pja2Q80U04 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms