Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Rexo1Q7TT28 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rexo1Q7TT28 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms