Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nphp3Q7TNH6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms