Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Abcg2Q7TMS5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms