Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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