Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Krt9Q6RHW0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Krt9Q6RHW0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms