Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cpa4Q6P8K8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms