Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

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Length 945 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Soga3Q6NZL0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Soga3Q6NZL0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Soga3Q6NZL0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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