Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp140Q6NSQ5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sp140Q6NSQ5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sp140Q6NSQ5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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