Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctr9Q62018 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctr9Q62018 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctr9Q62018 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctr9Q62018 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms