Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3Q60803 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf3Q60803 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms