Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Syne3Q4FZC9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Syne3Q4FZC9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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