Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Foxn3Q499D0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms