Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms