Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nlrc4Q3UP24 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms