Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TQQ9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms