Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
XylbQ3TNA1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms