Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Spatc1Q148B6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Spatc1Q148B6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Spatc1Q148B6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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