Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ttc39dQ0VF76 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms