Protein–RNA interactions for Protein: P97864

Casp7, Caspase-7, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp7P97864 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Casp7P97864 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Casp7P97864 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms