Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hps5P59438 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hps5P59438 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms