Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Usp5P56399 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms