Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gpc4P51655 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms