Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rpl13P47963 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpl13P47963 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms