Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P20040 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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P20040 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P20040 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P20040 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P20040 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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