Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RargP18911 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RargP18911 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RargP18911 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RargP18911 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RargP18911 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms